藏医内病科学现又称“藏医内科病学”之一，是藏医学关于一切内部脏腑病的重要基础学科，具有很多独到的理论观点，具有本民族的特色。这些理论不仅影响着内科疾病的理论，而且指导着其疾病的诊治。在某些疑难性疾病的诊治方面更具有指导意义和研究价值。

    藏医学认为，人体内一切疾病的主要根源是人体正常的消化、吸收和排泄等方面受到影响，即过于旺盛、过于衰竭或消退引起紊乱的持续情况下，体内的三因素、七大物质和三种排泄物的功能受到破坏，虽然在一定时间内不会立即引发疾病，也不会有明显的症状和体征，但条件成熟时，遇到致病因素的作用，就会引发各类体内疾病，甚至有些是致命的，如肿瘤等。这一观点主要在《四部医典》的第三部《藏医临床技能学》或译《秘诀医典》中有充分论述。在这些章节中涉及到的内容有：消化吸收障碍性疾病、肿瘤、浮肿病、痨病、水臌病等。藏医学的临床各类技能知识和秘诀，主要以各种疾病的病因、疾病的分类、疾病的症状和疾病的治疗几个部分和顺序来进行精密论述。其中第一章论述的是消化吸收障碍疾病的诊治；第二章论述的是肿瘤疾病的诊治，现在主要指两性肿瘤；第三章论述的是浮肿，现指水肿轻度；第四章论述的是浮肿的第二阶段，即水肿中度；第五章论述的是水臌病的诊治，现指水肿高度；第六章论述的是痨病的诊治。同时，其内容在排法顺序上有一定原因，藏医学认为，一切内脏疾病是由消化、吸收方面的障碍引起的，因此，就把这一疾病诊治放在了首位。