西藏的疾病预防控制工作取得了显著成绩，严重危害人民群众健康的传染病得到了有效控制。

    20世纪60年代，西藏与全国同步消灭了天花；80年代末和90年代中期实现了以自治区、县、乡为单位儿童计划免疫接种率达到三个85％的目标；2000年实现了无脊髓灰质炎状态。

    西藏自治区传染病总发病率、死亡率、病死率分别由1986年的2795／10万、9.54／10万、0.34％下降到2003年的373.25／10万、0.73／10万、0.20％。

    2002年，中央启动国债资金用于疾病预防控制中心建设以来，先后投资7634．2万元用于地、县疾病预防控制体系建设，投资8260万元用于医疗救治体系建设。对口援助省市也加大了援助力度，其中河南省援建西藏自治区重点传染病控制建设项目投资3000万元；贵州省援助600万元用于昌都地区地方病防治所建设。这些项目的实施有力地促进了西藏公共卫生事业的发展，提高了突发公共卫生事件应急能力。